intuitive resting state functional connectivity (iRSFC) toolbox

About iRSFC

• iRSFC는 intuitive resting-state functional connectivity의 약자 입니다.

• 가장 간단한 방법으로 휴자상태 뇌기능 연결성을 분석 할 수 있는 Matlab 기반의 툴박스 입니다.

• 기능 뇌네트워크를 분석할 수 있는 프로그램들을 이미 많이 있습니다. 하지만, 너무 많은 기능이 들어 있어서 사용하기가 쉽지 않고 기존에 Event-related fMRI (ER-fMRI) 연구를 하시던 분들이 사용하시게에 생소한 부분들이 많이 있습니다. iRSFC는 ER-fMRI 연구를 하셨던 분들이 쉽게 사용할 수 있도록 디자인한 프로그램입니다. 

• iRSFC toolbox를 구동하기 위해서는 SPM 툴박스를 미리 다운로드 받고 Matlab에서 Set Path를 설정해야 합니다.

Functionality

• Seed ROI based functional connectivity analysis: seed로 설정한 뇌영역과 다른 모든 뇌영역간의 functional connectivity를 계산해서 zmap으로 저장하는 기능을 수항햅니다. 이후 분석은 SPM의 [Specify 2nd-level] 메뉴를 통해서 진행하면 됩니다.

• Network analysis among ROIs: 연구자가 설정한 ROI 영역들간의 기능 연결성을 모두 계산해서 결과를 Comma Separated Values 의 형태로 저장하는 기능을 수행합니다. 이후에 분석은 SPSS 등으로 수행 가능합니다.

Download

• 아래의 링크에서 간단한 설문에 응답해 주시면 다운로드 링크를 보실 수 있습니다.

• 어떤 연구자들이 주로 프로그램을 사용하는지 알기 위한 설문이지, 최대한 성의것 응답해 주시면 추후에 프로그램을 업데이트 하는데 큰 도움이 될것 같습니다.

• 깃허브Github 다운로드 링크: https://github.com/skyeong/iRSFC

Hands-on Exercise

• 아래의 링크에 있는 메뉴얼을 다운로드 받아서 따라해 보세요^^

• 다운로드 링크: slideshare

iRSFC Workshop Info

1.  Sunghyon Kyeong, 'Hands-on workshop on intuitive Resting-State Functional Connectivity (iRSFC)', Department of Psychiatry, Chonbuk National University Hospital, 9 January, 2015. 
   (1) theoretical background on fMRI BOLD signal (40 min.) 
   (2) Hands-on exercise for fMRI preprocessing (60 min.) 
   (3) Hands-on exercise for iRSFC toolbox (90 min.) 
   (4) Multiple comparison issues and AlphaSim correction (20 min.)