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데이터과학/데이터 분석 실습

intuitive voxel-based lesion symptom mapping (iVLSM) toolbox

by 경성현 2015. 4. 15.

About iVLSM

  • iVLSM는 intuitive voxel-based lesion symptom mapping의 약자 입니다.

  • 가장 간단한 방법으로 병변과 증상간의 관계를 연구 할 수 있는 Matlab 기반의 툴박스 입니다.

  • 복셀 기반의 병변을 Overlap하고 병증과의 관계를 연구 할 수 있는 프로그램들을 이미 여러개가 있습니다. 하지만, 기능이 복잡하거나 사용 방법이 사용자에게 친숙하지 않기 때문에 연구하기에 제약도 많이 있습니다.

  • iVLSM toolbox를 구동하기 위해서는 SPM12 툴박스를 미리 다운로드 받고 Matlab에서 Set Path를 설정해야 합니다.

Functionality

  • Overlap of lesions: 개별 데이터에 병변을 ROI로 그렸다면, 해당 ROI들의 overlay map을 생성해 주는 기능을 수행합니다.

  • Lesion-symptom mapping: 각 볼셀별로 병변이 있는 환자들과 병변이 없는 환자들을 나누고, 여러가지 임상 척도가 연구자가 나누어진 그룹 간에 통계적으로 유의미한 차이가 있는지 통계분석을 수행하는 기능을 제공합니다. 제공되는 통계방법으로는 Independent sample t-test와 Mann-Whitney U test가 있습니다. 적절한 통계 방법을 선택해서 연구를 수행하시면 됩니다.

Download

  • 아래의 링크에서 간단한 설문에 응답해 주시면 다운로드 링크를 보실 수 있습니다.

  • 어떤 연구자들이 주로 프로그램을 사용하는지 알기 위한 설문이지, 최대한 성의것 응답해 주시면 추후에 프로그램을 업데이트 하는데 큰 도움이 될것 같습니다.

  • 깃허브Github 다운로드: https://github.com/skyeong/iVLSM

Hands-on Exercise